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菌種的培養一般是按照下面幾種方式進行培養，1. 取出菌種培養物，將其接種到含有培養基的培養皿中。2. 在恒溫搖床上進行培養，溫度、時間和培養方式需要根據不同菌種而定。3. 篩選出生長良好、純度高的菌種，進行后續處理。接著進行菌種的冷凍，快速冷凍一般采用使用液氮浸泡法或酒精浴法。也可以直接菌種直接上載到凍干盤內在凍干機內直接預凍，然后經過一次升華二次升華，最后菌種經過凍干后出倉，一般凍干時間大約在40小時左右。為了提高凍干效率可采用離心得到菌泥，然后在添加一定比例的凍干保護劑在進行凍干，糖類物質對菌體凍干保護效果較好。
菌種凍干機的特點：性價比高，整機性能穩定，菌種凍干機可連續長時間運行，配置國外品牌大冷阱，大真空泵，后續維護簡單。 一般一平米凍干機可凍干菌泥約10公斤，一般菌種凍干批量生產可選擇2-10平凍干機，可提供菌種凍干工藝配方開發。
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